Würde mich auch für die AMD-Version entscheiden.
Ich verbau seit Jahren MSI-Mainboards und hab damit gute Erfahrungen gemacht.
Beim Tower könnte man noch etwas sparen... wenn das Teil eh nur unter deinem Tisch steht brauchst du auch kein Fenster.
(Tipp: Sharkoon Avenger, Economy - Preis ~35EUR)
Bei der Graka würd ich das kleinere Modell nehmen. Alternative eine GeForce GTS250(1GB GDDR). (~110EUR)